Computational analysis of genomic variants affecting predicted microRNA:target interactions in prostate cancer.

Prostate cancer (PCa) is the most common cancer of men in the United States and is third only to lung and colon as a cause of cancer death. Clinical behavior of the disease is variable and the combination of prostate-specific antigen (PSA) screening and Gleason score staging are currently the best available molecular and pathology tools to predict outcomes. Cancer biology research establishes microRNAs (miRNAs) as key molecular components in both normal and pathological states. Thus, elucidating miRNAs perturbed by genomic alterations will expand our understanding of the molecular taxonomy of PCa with the aim to complement current practices in the diagnosis, prognosis, and treatment of the disease. This study reports the computational analysis of genomic variants affecting the seed sequence of five miRNAs, changing the prediction of microRNA:target interactions in PC3, an androgen-independent cell line that closely resembles prostatic small cell neuroendocrine carcinoma (SCNC). Genomic variants were detected via deep-sequencing of PC3 and further computational work focused on mapping changes within the seed sequence of predicted mature miRNAs. Five microRNA candidates (from now on denominated microRNA*) with changes in the g2-g8 seed region were selected: miR-3161*-5p with rs35834266 G\u3einsA; miR-3620*-5p with rs2070960 C\u3eT; miR-1178*-5p with rs7311975 T\u3eG; miR-4804*-5pwith rs266435 C\u3eG; and miR-449c*-3p with rs35770269 A\u3eT. Subsequently, the computational prediction of miRNA*:target interactions revealed 643 new relationships. After functional enrichment analysis of new targets, seven genes were associated with endocrine resistance (ABCB11, CDKN1B, NOTCH2, SHC4, CCND1, SP1, ADCY2) and five genes with endocrine and other factor regulated calcium reabsorption (ATP1A2, ESR1, PRRKCB, AP2B1, SLC8A1) categories. A gene-disease association literature search was performed for each of the aforementioned genes in order to understand if they have been implicated in cancer, where CDKN1B, NOTCH2, CCND1 have been reported to participate in prostate cancer progression. Microarray gene expression analyses showed that few predicted microRNA* targets were underexpressed in untreated PC3 samples versus prostate epithelial cells from the GEO database. However, after assessing the frequency of observed underexpressed genes per candidate microRNA* using a Fisher’s exact test, miR-4804*-5p target genes (TNKS and GUCY1A3) were statistically significant. Next steps included the comparison between groups of genes subject to non-mutated microRNA and mutated microRNA* regulation using a Kruskal-Wallis non-parametric test. Results were consistent with the microRNA-gene expression regulation model despite the genomic variant in the seed region, nevertheless the effect of miR-3161*-5p, miR-3620*-5p, miR-1178*-5p, miR-4804*-5p, and miR-449c*-3p cannot be predicted solely with the indirect experimental approach that microarray gene expression platforms provide. For this reason, the assessment of recurrent pairwise microRNA-mRNA expression associations was performed using CancerMiner, an online tool from The Cancer Genome Atlas (TCGA) based on a multivariate linear model and rank transformations. Only the relationship of miRNA-3161:CDKN1B was retrieved as a recurrent expression association in uterine corpus endometrial carcinoma (UCEC). In the context of this study, results suggest that CDKN1B (p27Kip1)dysregulation by miR-3161*-5p would be leading to PC3 super proliferation due to the lack of cell cycle arrest from phase G1 to S. Prostate cancer cell line PC3 has shown to share features with prostatic small cell neuroendocrine carcinomas (SCNC) with the implication that molecular mechanisms and therapeutic efficacies observed with PC3 cells are likely applicable to SCNC1. Prostatic small cell neuroendocrine carcinoma is a variant form of prostate cancer often characterized by an aggressive course with a poor response to conventional androgen deprivation therapy (ADT), consistent with the lack of the androgen receptor in prostatic small cell carcinoma (SCC)2. In some men treated with ADT, development of small cell carcinoma might represent the “escape” of a subpopulation of hormone-independent cells resulting from the selective pressure of hormonal therapy3. Hence, the suggestion of CDKN1B dysregulation by miR-3161*-5p might go beyond the idiosyncrasy of the PC3 cell line, but rather an interesting future direction to investigate prostate cancer patients with SCNC rendering to an adverse disease outcome due to uncontrolled cell proliferation

La imagen y la narrativa como herramientas para el abordaje psicosocial en escenarios de violencia en los departamentos del Atlántico, Bolívar y Magdalena.

La violencia generada por el conflicto armado en Colombia, ha marcado la historia del País por más de 60 años, el cual ha ocasionado múltiples consecuencias entre ellas, el desplazamiento forzado, el exilio, atentados, violencia sexual, homicidios, torturas, masacres entre otras. En el presente trabajo se realiza un análisis del caso de Shimaia, una mujer que ha sido víctima del conflicto armado desde sus ancestros hasta la actualidad, la cual se ve obligada junto a más de cientos de familias a desplazarse a otro lugar en busca de la supervivencia, dejando sus casas, pertenencias, culturas, creencias y una historia de vida. Así mismo se realiza análisis sobre el caso del salado, Carmen de bolívar, una población que vivió una época de abundante terror, en el año 2000 durante 72 horas presenciaron asesinatos, violaciones, masacres que marcó su vida para siempre, sin embargo, está comunidad demuestra ser resiliente con ganas de transformar sus realidades buscando la verdad, reparación y justicia. Por último, se presenta análisis de los diferentes contextos de Colombia a través de la herramienta de foto voz, la cual permitió conocer la historia del País desde diferentes escenarios y los diferentes recursos de afrontamiento y reparación a las víctimas y sobrevivientes del conflicto armado.The violence generated by the armed conflict in Colombia has marked the history of the country for more than 60 years, which has caused multiple consequences. Examples include forced displacement, exile, attacks, sexual violence, homicides, torture, massacres, among others. In the present, groups analyze the case of Shimaia, a woman who has been a victim of the armed conflict from her ancestors to the present. This survivor was forced together with over hundreds of families to move towns in search of survival. They left their homes, belongings, cultures, beliefs and life stories. Likewise, an analysis is carried out on the case of El Salado, Carmen de Bolívar, a population that lived during a time of abundant terror. In the year 2000, for 72 hours they witnessed murders, rapes, and massacres that marked their lives forever. However, this community proves to be resilient with the desire to transform their realities in search of truth, reparation, and justice. Finally, an analysis of the different contexts of Colombia is presented through the photovoice tool, which allows us to know the history of the country from different scenarios. It shows all the different coping habits and reparation resources for the victims and survivors of the armed conflict

Construcción de paz en el posacuerdo: avances, tensiones y desafíos

Este texto presenta investigaciones que, desde las ciencias sociales, aportan evidencia sobre los diferentes desafíos que supone la construcción de paz en el escenario del posacuerdo en Colombia. Soportados por investigaciones cuantitativas y cualitativas, los autores plantean reflexiones teórico-prácticas acerca de fenómenos sociales y políticos ligados a procesos de transición de una cultura de la guerra a una cultura de paz, que anteceden el acuerdo de paz firmado por el Estado colombiano y las Farc-EP en el 2016; además, se socializan estudios sobre actores y procesos políticos vinculados a la implementación temprana del acuerdo, sus avances y obstáculos. Los trabajos compilados delimitan objetos de estudio que profundizan o explican, según el caso, temáticas vinculadas a la construcción de paz en la escala nacional y regional

Evaluación de la seguridad de productos cosméticos

ilustracionesLa Organización de las Naciones Unidas para el Desarrollo Industrial (onudi), a través del programa Safe+, coordinó varias estrategias de cooperación internacional para apoyar el crecimiento de la industria cosmética colombiana, entre ellas la capacitación en evaluación de la seguridad de productos cosméticos. En este contexto, en 2018, una de las acciones que emprendió la Universidad Nacional de Colombia, fue ofertar el Curso de Formación de Consultores en Evaluación de Seguridad de Productos Cosméticos, a través del Departamento de Farmacia de la Facultad de Ciencias, con la asesoría y el diseño del consultor internacional Dr. Philippe Masson. En 2022, esta capacitación fue ampliada en número de horas impartidas, lo que permitió realizar el Diplomado en Evaluación de la Seguridad de Productos Cosméticos (Safety Assessor Training), en la modalidad telepresencial, el cual contó con la participación de más de 30 expertos. Este documento presenta los resúmenes de 53 conferencias, que hicieron parte de seis módulos: 1) contexto regulatorio de las materias primas y cosméticos; 2) aspectos de seguridad relacionados con ingredientes y productos cosméticos; 3) fundamentos de fisiología, inmunología y toxicología; 4) herramientas de evaluación toxicológica; 5) gestión del riesgo y gestión documental en la evaluación de seguridad de cosméticos; y 6) asuntos de interés en la actualidad. Esperamos con este diplomado contribuir con los fines misionales de la Universidad Nacional de Colombia, a través de la educación continua y permanente con carácter científico y tecnológico dirigida a profesionales de la industria cosmética. (Texto tomado de la fuente)Introducción -- Importancia de la formación en evaluación de seguridad para el sector cosmético -- Evaluación de calidad de productos cosméticos: introducción -- Bibliografía recomendadaMódulo 1. Contexto regulatorio de las materias primas y cosméticos -- Situación normativa en Latinoamérica con relación a la seguridad de cosméticos -- Legislación de cosméticos en la Comunidad Andina de Naciones (can) y su influencia en Colombia -- Referencias regulatorias con relación a la seguridad de cosméticos: Unión Europea y Estados Unidos -- Referencias regulatorias con relación a la seguridad de cosméticos: Asia -- Normas técnicas internacionales en seguridad de productos cosméticos -- Bibliografía recomendadaMódulo 2: aspectos de seguridad relacionados con ingredientes y productos cosméticos -- Seguridad de productos cosméticos – Quality by Design -- Origen de los ingredientes cosméticos -- Ingredientes cosméticos obtenidos por síntesis química -- Ingredientes cosméticos de origen natural -- Ingredientes cosméticos de origen biológico y biotecnológico -- Disposiciones particulares relativas a las fragancias -- Clasificación de ingredientes cosméticos y restricciones -- Estabilidad a lo largo del ciclo de vida del producto -- Estabilidad fisicoquímica -- Estabilidad microbiológica -- Envase seguro: ingeniería de envases -- Envase seguro: extractables y lixiviados de envases -- Bibliografía recomendadaMódulo 3. Fundamentos de fisiología, inmunología y toxicología -- Fundamentos: sistema inmune y piel -- Fundamentos: piel y mucosas, organización y funciones -- Evolución de la piel con la edad -- Irritación cutánea, ocular y mucosas -- Alergenicidad y sensibilización cutánea -- Fotosensibilidad cutánea y fotoirritación -- Conceptos generales en toxicología: evaluación del riesgo toxicológico -- Penetración y absorción percutánea -- Toxicidad general por vía oral y tópica -- Toxicidad de la reproducción -- Genotoxicidad, mutagenicidad y cáncer -- Bibliografía recomendadaMódulo 4. Herramientas de evaluación toxicológica -- Métodos experimentales in vivo y sus límites -- Metodologías in vitro para la evaluación de seguridad de ingredientes cosméticos -- Métodos in vitro. Experiencias en el laboratorio -- Evaluación de la penetración cutánea -- Métodos in silico como fuentes adicionales de información -- Estudios clínicos para la evaluación de cosméticos -- Cálculo del margen de seguridad -- Umbral de preocupación toxicológica (ttc) -- Bibliografía recomendadaMódulo 5. Gestión del riesgo y gestión documental en la evaluación de la seguridad de cosméticos -- Buenas prácticas de laboratorio -- Calidad de los datos experimentales -- Dossier, pif o expediente de información de producto -- Gestión del riesgo -- Caracterización y gestión del riesgo -- Acceso a los datos de ingredientes cosméticos a través de los comités científicos sccs, cir -- Claims / proclamas -- Claims vs. Soportes -- Bibliografía recomendadaMódulo 6. Asuntos de interés en la actualidad -- Uso de nanomateriales en productos cosméticos: ¿es un riesgo? -- Disrupción endocrina -- Impacto de los cosméticos en el ambiente – Cosmetovigilancia -- Pieles sensibles: consideraciones generales y aspectos reglamentarios -- Ética y estudios de seguridad -- Nuevas aproximaciones metodológicas (nam) -- Bibliografía recomendad

Zoonosis, cambio climático y sociedad

La sociedad contemporánea se enfrenta a uno de los retos más grandes de la historia humana, el calentamiento global, mismo que acarrea enormes consecuencias, tales como los disturbios climáticos, así como los patrones de las enfermedades de origen animal transmisibles al hombre. Precisamente ante este escenario las instituciones educativas de nivel superior deben dar cumplimiento a su responsabilidad y ser las generadoras de alternativas de solución mediante el trabajo especializado de investigación; y para ello, la pesquisa científica es la mejor de las alternativas a nuestro alcance para comprender y encarar estos desafíos.Universidad Autónoma del Estado de México y Ediciones y Gráficos Eón, S.A. de C.V

Volteando la tortilla. Género y maíz en la alimentación actual de México.

Ante escenarios complejos, patriarcales y desoladores que dejan ver el neoliberalismo, la globalización agroalimentaria, el calentamiento global y las contaminaciones de granos nativos por la imposición de transgénicos, nos cuestionamos si existen algunas alternativas para preservar el maíz nativo como un recurso multiestratégico (alimentario, económico, cultural, ecológico y tecnológico) tomando en cuenta las condiciones actuales de desigualdades sociales de género, etnia, clases y edad que predominan en el campo mexicano. Para responder a algunos cuestionamientos, este libro presenta algunas alternativas a través de diversas experiencias femeninas y de relaciones de género en torno al maíz y la alimentación. Todas ellas muestran que es posible construir una masa crítica para salvaguardar el maíz nativo bajo esas condiciones desoladoras, pero siempre y cuando se “voltee la tortilla”, metáfora que da pie al inicio de otra realidad humanizada y en sincronía con la naturaleza.Proyecto realizado con financiamiento Conacy

PPARs and Their Neuroprotective Effects in Parkinson’s Disease: A Novel Therapeutic Approach in α-Synucleinopathy?

Parkinson’s disease (PD) is the most common α-synucleinopathy worldwide. The pathognomonic hallmark of PD is the misfolding and propagation of the α-synuclein (α-syn) protein, observed in post-mortem histopathology. It has been hypothesized that α-synucleinopathy triggers oxidative stress, mitochondrial dysfunction, neuroinflammation, and synaptic dysfunction, leading to neurodegeneration. To this date, there are no disease-modifying drugs that generate neuroprotection against these neuropathological events and especially against α-synucleinopathy. Growing evidence suggests that peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) agonists confer neuroprotective effects in PD, however, whether they also confer an anti-α-synucleinopathy effect is unknown. Here we analyze the reported therapeutic effects of PPARs, specifically the gamma isoform (PPARγ), in preclinical PD animal models and clinical trials for PD, and we suggest possible anti-α-synucleinopathy mechanisms acting downstream from these receptors. Elucidating the neuroprotective mechanisms of PPARs through preclinical models that mimic PD as closely as possible will facilitate the execution of better clinical trials for disease-modifying drugs in PD

PPARs and Their Neuroprotective Effects in Parkinson’s Disease: A Novel Therapeutic Approach in α-Synucleinopathy?

Parkinson’s disease (PD) is the most common α-synucleinopathy worldwide. The pathognomonic hallmark of PD is the misfolding and propagation of the α-synuclein (α-syn) protein, observed in post-mortem histopathology. It has been hypothesized that α-synucleinopathy triggers oxidative stress, mitochondrial dysfunction, neuroinflammation, and synaptic dysfunction, leading to neurodegeneration. To this date, there are no disease-modifying drugs that generate neuroprotection against these neuropathological events and especially against α-synucleinopathy. Growing evidence suggests that peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) agonists confer neuroprotective effects in PD, however, whether they also confer an anti-α-synucleinopathy effect is unknown. Here we analyze the reported therapeutic effects of PPARs, specifically the gamma isoform (PPARγ), in preclinical PD animal models and clinical trials for PD, and we suggest possible anti-α-synucleinopathy mechanisms acting downstream from these receptors. Elucidating the neuroprotective mechanisms of PPARs through preclinical models that mimic PD as closely as possible will facilitate the execution of better clinical trials for disease-modifying drugs in PD